Der Werre-Wasserverband setzt sich aus den Organen Vorstand, Verbandsversammlung und Geschäftsstelle zusammen. Die Verbandsversammlung besteht aus den gewählten Vertretern der Mitglieder. Sie entscheidet gemeinsam mit dem Vorstand über die Vorhaben und Aktivitäten des Werre-Wasserverbandes. Die Organe setzen sich wie folgt zusammen:
Vorstand
Verbandsvorsteher
Kreisdirektor Markus Altenhöner
Kreis Herford
(stv. Verbandsvorsteher)
Dr. Axel Lehmann
Kreis Lippe
Tanja Möller
Stadt Bielefeld
Klemens Fuhrmann
Kreis Minden-Lübbecke
Verbandsversammlung
Die Mitglieder des Werre-Wasserverbandes sind die Kreise Herford, Lippe, Minden-Lübbecke und die kreisfreie Stadt Bielefeld im Einzugsgebiet der Werre mit Ausnahme des Kreises Gütersloh und der niedersächsischen Gebiete. Die Kreise entsenden Vertreter in die Verbandsversammlung des Werre-Wasserverbandes. Die Vertreter und Stellvertreter in der Verbandsversammlung sind in der folgender Übersicht aufgeführt.
Kreis Herford
Kreis Lippe
Kreis Minden-Lübbecke
Stadt Bielefeld
Vertreter
Markus Altenhöner
Hans Ebmeyer
Hartmut Golücke
Joachim Sprengel
Angelika Fleischer
Dr. Ute Röder
Christian Bodem
Marianne Rautenberg
Friedrich-Wilhelm Sundhoff
Jürgen Georgi
Lutz Freiberg
Moritz Brünger
Frank Helming
Christian Wunsch
Thomas Dippert
Bernd Henrichsmeier
Carla Steinkröger
Ole Heimbeck
Klaus Peter Johner
Franz-Josef Tewes
Stellvertreter
Dr. Beatrix Wallberg
Christian Antl
Ulrich Rolfsmeyer
Detlef Kaase
Ingo Ellermann
Rüdiger Kuhlemann
Ralf Grünert
Heidi Lagemann
Jan Wisomiersky
Timo Broeker
Gerd Sander-Nather
Martina Busche-Oberpenning
Angelika Buttler
Reinhard Wandtke
Holger Hansing
Tanja Orlowski
Tim Pollvogt
Jennifer Wittrowski
Klaus Feurich
Rainer Seifert
Geschäftsstelle
Geschäftsführer
Steffen Veenaas
Nadine Brieskorn
Nadin Möller
Fabian Firus
Marion Lachner
Jenni Graf